The Worst Case Complexity of Maximum Parsimony

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

The Worst Case Complexity of Maximum Parsimony

One of the core classical problems in computational biology is that of constructing the most parsimonious phylogenetic tree interpreting an input set of sequences from the genomes of evolutionarily related organisms. We reexamine the classical maximum parsimony (MP) optimization problem for the general (asymmetric) scoring matrix case, where rooted phylogenies are implied, and analyze the worst...

متن کامل

1 Worst - Case vs . Average - Case Complexity

So far we have dealt mostly with the worst-case complexity of problems. We might also wonder aobut the average-case complexity of a problem, namely, how difficult the problem is to solve for an instance chosen randomly from some distribution. It may be the case for a certain problem that hard instances exist but are extremely rare. Many reductions use very specifically constructed problems, so ...

متن کامل

the effect of task complexity on lexical complexity and grammatical accuracy of efl learners’ argumentative writing

بر اساس فرضیه شناخت رابینسون (2001 و 2003 و 2005) و مدل ظرفیت توجه محدود اسکهان (1998)، این تحقیق تاثیر پیچیدگی تکلیف را بر پیچیدگی واژگان و صحت گرامری نوشتار مباحثه ای 60 نفر از دانشجویان زبان انگلیسی بررسی کرد. میزان پیچیدگی تکلیف از طریق فاکتورهای پراکندگی-منابع تعیین شد. همه ی شرکت کنندگان به صورت نیمه تصادفی به یکی از سه گروه: (1) گروه موضوع، (2) گروه موضوع + اندیشه و (3) گروه موضوع + اندی...

15 صفحه اول

Worst case complexity of direct search

In this paper we prove that the broad class of direct-search methods of directional type based on imposing sufficient decrease to accept new iterates shares the worst case complexity bound of steepest descent for the unconstrained minimization of a smooth function, more precisely that the number of iterations needed to reduce the norm of the gradient of the objective function below a certain th...

متن کامل

Worst - Case Complexity of Recursive Procedures

The purpose of this paper is to show that recursive procedures can be used for implementing real-time applications without harm, if a few conditions are met. These conditions ensure that upper bounds for space and time requirements can be derived at compile time. Moreover they are simple enough such that many important recursive algorithms can be implemented, for example Mergesort or recursive ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Journal of Computational Biology

سال: 2014

ISSN: 1066-5277,1557-8666

DOI: 10.1089/cmb.2014.0128